Análisis continuo de la ribonucleasa A
Xabier López de la facultad de Química de la UPV lleva 5 años inmerso en un proyecto. Recientemente ha regresado a la facultad de Química de San Sebastián para continuar con la investigación. Hemos tenido la oportunidad de hablar con él y su ex profesor Jesús Ugalde sobre este proyecto que aborda el tema de las proteínas.
Las proteínas, las enzimas, son los catalizadores de las reacciones. Su función como agente de reacciones está directamente relacionada con las enfermedades. Por tanto, entendiendo cómo trabajan, es posible evitar o frenar esas enfermedades.
Xabier trabaja con la enzima A ribonucleasa (A RNasa). La función de esta importante enzima consiste en romper la cadena aérea. El transmitente de información genética, ARN, se divide en nucleótidos una vez utilizado. Para ello, A RNasa corta la cadena aérea.
Aunque la estructura de la ribonucleasa A fue conocida hace 30 años, todavía no han encontrado la clave de su funcionamiento. En ese camino el descubrimiento del genoma humano ha sido un paso, pero lo siguiente es saber qué pasa con esta secuencia. “From the secuence to the consecuence”, de la secuencia a la conclusión.
En el caso de A RNasa todavía es conocida la estructura cristalina, la estructura estática. ’No sabemos cómo se mueve, ni qué estructura tiene cuando trabaja’, afirma Xabier.
Métodos de estudio
Todas estas proteínas son analizadas por espectroscopia o método RMN. El conocido método RMN sólo sirve para el estudio de pequeñas proteínas. La espectroscopia por difracción de rayos X sólo puede estudiar la estructura cristalina. Para poder conocer cuál es el comportamiento de las proteínas en movimiento sería necesaria una espectroscopia muy rápida, capaz de sacar un gran número de fotos en poco tiempo. Lamentablemente, a pesar de los avances realizados, esta técnica no está desarrollada de momento.
Este proceso, que se inicia experimentalmente, analiza todos los pasos de la reacción, considerando la geometría y los niveles energéticos de las proteínas. Por otra parte, teóricamente, se plantea la ecuación de la energía en función de las posibles vías de reacción. Al tratarse de un proceso que no es perfecto, se realizan varios supuestos y al final se comprueba si se han cumplido o no estas propiedades. Así, los resultados de la parte experimental y teórica coinciden en un “feedback”.
Este proyecto, que combina instinto químico, físico e informática, tendrá sin duda un largo seguimiento.
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