Détection de Salmonella en 24 heures
Le Département d'immunologie, de microbiologie et de parasitologie de l'UPV-EHU a réalisé en 2002 la nécessité de développer des méthodes plus rapides de détection de Salmonella dans les aliments, et un projet de recherche a été lancé en collaboration avec la société alavaise Laboratoires Bromatologiques Araba et le centre technologique Leia.
Méthodes génétiques
Des recherches ont commencé dans le domaine des méthodes génétiques. Pour cela, il est indispensable de bien connaître le génome de la bactérie. Heureusement, plusieurs souches de Salmonella sont parfaitement séquencées. Ils savent également qu'il y a des gènes de Salmonella qui n'apparaissent pas dans d'autres bactéries ou êtres vivants. Par conséquent, si ces gènes sont détectés, vous pouvez clairement voir où la bactérie de Salmonella est. Bien que le micro-organisme ne soit pas détecté, nous trouverions son ADN.
En recherchant l'ADN de la bactérie, les chercheurs ont développé différentes techniques qui détectent la présence de Salmonella dans les aliments pendant 24 heures. Cependant, ces méthodes basées sur la détection d'ADN ont un problème: La molécule d'ADN est très stable. C'est précisément pourquoi on peut analyser l'ADN des personnes décédées plusieurs années auparavant. Quelque chose de semblable peut se produire dans les bactéries. Autrement dit, l'ADN de la bactérie morte peut être étudié en pasteurisation et/ou stérilisation. Par conséquent, pour détecter Salmonella, il ne suffit pas d'étudier l'ADN, car de cette façon, vous ne pouvez pas savoir si la bactérie est vivante ou morte.
Par conséquent, les chercheurs de l'UPV ont utilisé un autre marqueur plus spécifique qui indiquera si la bactérie est vivante ou non. Cette molécule est un ARN messager. C'est une molécule instable, facilement dégradable. Il n'apparaît que lorsque la bactérie est vivante. Une fois la bactérie morte disparaît avec la bactérie. Conscients de cela, des chercheurs de l'UPV ont développé la détection de l'ARN. D'une part, un processus d'extraction d'ARN a été conçu dans les aliments et, d'autre part, on a étudié comment convertir cet ARN en ADN. Les techniques de détection fonctionnent avec ADN.
Travailler avec ARN avec une grande précision et rapidité. Sinon, il est possible que les résultats ne soient pas corrects et que les aliments dans lesquels se trouve la bactérie Salmonella reçoivent des résultats inverses en raison de la dégradation de la molécule. Par conséquent, le processus d'extraction de l'ARN est aussi fondamental qu'important.
Une fois le messager extrait de l'ARN, il est converti en ADN par le processus appelé transcription inverse. Dans ce processus, une copie de l'ADN est synthétisée. Pour détecter la séquence d'ADN spécifique de Salmonella, le PCR a été utilisé en temps réel. Cette copie de l'ADN est détectée par plusieurs sondes. Les sondes sont des chaînes auxiliaires de l'ADN de Salmonella et sont marquées par un composé fluorescent. Si cette technique combine la copie de l'ADN avec la chaîne auxiliaire, ce composé fluorescent émet un signal. Cet appareil permet en outre de quantifier la réaction, c'est-à-dire d'afficher le nombre de cellules de Salmonella présentes dans l'aliment. Les résultats du PCR sont analysés par des graphiques et une interprétation est réalisée.
En bref, les chercheurs de l'UPV combinent différentes techniques. D'une part, ils utilisent des techniques d'extraction, d'autre part, ils conçoivent des sondes et, enfin, ils détectent des molécules d'ADN et d'ARN. L'utilisation de ces dernières techniques permet d'accélérer la détection des bactéries Salmonella et d'accroître la sécurité alimentaire.
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