No obstant això, netejar l'aigua utilitzada a casa o en el taller és més difícil que rentar la disfressa de carnestoltes. La indústria paperera i la que fabrica pots de conserva no embruta l'aigua de la mateixa manera. La primera genera contaminació química i la segona contaminació orgànica. Cada tipus d'indústria requereix d'un sistema de depuració adequat a la seva naturalesa. L'explicació de tots trigaria a aparèixer i, per això, només esmentarem els principals cadàvers, encara que deixem diverses coses en el camí. No obstant això, pel seu caràcter més general, ens remetrem en primer lloc a la depuració de les aigües residuals urbanes.
Les principals impureses de les aigües residuals urbanes són els minerals i la matèria orgànica, transportats en suspensió o dissolució. La característica més important de les aigües residuals urbanes és la seva biodegradabilitat, és a dir, la seva neteja mitjançant tractaments biològics. No obstant això, abans de realitzar aquests tractaments biològics, existeixen altres processos a seguir:
Les depuradores del nostre entorn poden ser similars a les anteriorment esmentades, més senzilles o més complexes. El grau de depuració desitjat i les característiques específiques de les aigües residuals determinen el funcionament de la depuradora. A vegades les aigües residuals són sotmeses a un tercer tractament per a eliminar els compostos orgànics romanents i les sals dissoltes. Per a això s'utilitzen adsorcions, intercanvi iònic o osmosi inversa, però en ser tècniques costoses, el seu ús és molt reduït en les depuradores. En general es realitza un pretractament i un primer i segon tractament de les aigües residuals urbanes.
Les aigües residuals industrials són de la mena d'activitat industrial. No obstant això, la contaminació que genera la indústria en l'aigua és puntual i es resol amb una depuradora específica per a cada tipus d'indústria. Les indústries agràries i alimentàries generen una elevada contaminació orgànica i les seves aigües residuals són depurades principalment mitjançant tractaments biològics. Aquestes aigües tenen un tractament similar al descrit per a les aigües residuals urbanes.
La indústria paperera, per part seva, genera una gran quantitat de residus que no es dissolen en l'aigua, com són les fibres perdudes en el procés de fabricació i components que milloren la qualitat del paper (carbonat càlcic, sílice, midó...). Per això, les aigües residuals generades per aquesta activitat es netegen mitjançant depuració físic-química, és a dir, mitjançant cicles de floculació/decantació. Els principals contaminants són els hidrocarburs en refineries i en la indústria del petroli. Al costat d'ells, les aigües residuals abocades inclouen matèria orgànica, àcids, composts de sofre i matèria en suspensió. Tota aquesta matèria se separa per decantació primer i per floculació després. Posteriorment es pot realitzar una depuració biològica, però l'aigua no pot contenir metalls ni sulfurs. L'esmentat procés de depuració és, lògicament, vàlid per als abocaments controlats. Per desgràcia, el petroli contamina més per accidents o per l'ús de productes derivats.
Cada activitat industrial disposa d'un mètode de depuració específic, però en general són combinacions dels mètodes esmentats per a les aigües residuals urbanes. Atès que la font de contaminació és coneguda i geogràficament puntual, n'hi ha prou amb utilitzar la depuradora per a solucionar el problema. En l'agricultura, no obstant això, la font de contaminació és coneguda però molt estesa geogràficament. Per això, és més difícil fer front a la contaminació produïda per l'agricultura, ja que els contaminants no s'incorporen als rius en un lloc concret, sinó de manera dispersa.
No obstant això, existeixen algunes vies per a combatre la contaminació produïda per l'agricultura. Un d'ells pot ser el bosc de ribera. Els arbres absorbeixen els abonaments i pesticides vessats per l'agricultura i els incorporen als seus cicles biològics (els utilitzen com a aliment) i els contaminants no arriben als rius. La implantació d'aquesta mena de boscos ha demostrat la seva eficàcia. En cas contrari, el riu és, almenys en part, capaç de consumir i diluir aquests contaminants. No obstant això, al País Basc l'agricultura no produeix contaminació extrema. Les aigües residuals industrials i domèstiques són realment preocupants. Moltes vegades s'han pres mesures, però encara queda per fer.