Identification génétique des animaux domestiques
Le génome des mamaliens (ensemble d'information génétique qui est placé dans les cellules) typique a 3.000 millions de paires de nucléotides, organisées dans une séquence linéaire et avec un contenu instructif énorme. La variabilité génétique existante entre les individus de la même espèce est également énorme. Si nous connaissions tout le génome d'un individu et lisions celui d'un autre, nous trouverions au moins un million de nucléotides différents !
de gènes (c.-à-d. un produit, par exemple. une protéine, en dehors des séquences qui forment une règle d'ébullition, apparaissent des séquences qui pour nous n'ont pas de signification. Le manque de fonction de ces séquences peut parfois être un avantage, car ils peuvent avoir des différences entre l'individu et l'individu, de sorte qu'ils peuvent être considérés comme des marqueurs spécifiques des individus. Parmi ces séquences se trouvent plusieurs séquences appelées microsatellites ou SHORSTR (Short Tandem Repeat) formées par des séquences très courtes (de 2, 3 ou 4 nucléotides) situées dans le tandem (une successivement). Les STR sont très polymorphes (variables) et sont donc très utiles dans certaines applications de la biologie des populations, comme nous le verrons plus loin.
Notre équipe a une vaste expérience dans l'analyse et l'évaluation de la variabilité génétique des populations d'animaux domestiques avec des marqueurs. En effet, par les caractéristiques orographiques d'Euskal Herria, et par l'effort accompli par les baserritarras et les éleveurs d'ici pour maintenir les races autochtones, les races autochtones se sont maintenues pendant des siècles autour de nous. Nous avons 15 races autochtones, dont 6 en danger et 7 en état critique de conservation. D'autre part, dans certaines de ces races, dans le but d'augmenter leur production, Hasle Elkartea mène actuellement des plans d'amélioration avec la collaboration des Députations et du gouvernement. Comme tous les plans d'amélioration sont basés sur des données généalogiques et de production, il est impératif d'éviter les erreurs généalogiques qui diminuent la réponse à la sélection. Nous envisageons donc le développement d'un système génétique servant dans les plans de conservation et d'amélioration de nos races, basé sur des marqueurs génétiques polymorphes appelés STR.
La sélection de STRs pour effectuer ce travail peut être facilement expliquée. Ces courtes séquences peuvent être amplifiées par PCR (Réaction enchaînée de la polymérase), obtenant un grand nombre de ces séquences à partir d'une petite quantité d'ADN. Cela facilitera grandement toutes les analyses ultérieures. La technique PCR permet d'amplifier plusieurs STR simultanément. Il nous permet donc d'accéder simultanément à l'information des différentes régions du génome (locus). En outre, grâce à la technologie développée ces dernières années, des appareils ont été développés qui permettent la détection simultanée de fragments d'ADN ou d'allèles marqués avec différents fluorochromes (différentes séquences d'individus dans un locus donné). Dans notre cas, nous utilisons un analyseur génétique appelé ABI-Prism 310, qui effectue une électroforèse capillaire pour la résolution des différents allèles et qui est capable de détecter au laser différents allèles. Cet appareil présente les résultats sous forme informatisée. Tout cela garantit la vitesse, la standardisation et surtout la qualité des analyses.
Avec cette technologie de pointe, nous prétendons développer un système HD par STR, en cherchant un contrôle efficace de l'identité des animaux. Cela suppose surtout un avantage décisif pour la détermination de la paternité. Comme mentionné précédemment, les STRs sont très variables (5-10 allèles par locus) et la technologie utilisée permet une étude simultanée de 11-12 locus. Par conséquent, nous aurons une grande capacité à identifier génétiquement les différents individus et une façon d'affirmer avec une grande probabilité qu'un enfant a un mâle comme parent. D'autre part, nous serons capables de quantifier la variabilité des populations intégrées par ces individus. Enfin, si nous comparons différentes populations, nous pourrons analyser les relations entre elles, car cette connaissance peut être très importante pour connaître l’histoire évolutionnaire de nos races.
Nous prétendons, dans la mesure du possible, répondre aux besoins des éleveurs avec nos services et que nos résultats servent au développement du secteur primaire.
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