Identificació genètica d'animals domèstics
El genoma dels mamalios (conjunt d'informació genètica que es col·loca en les cèl·lules) típic té 3.000 milions de parells de nucleòtids, organitzats en una seqüència lineal i amb un contingut informatiu enorme. La variabilitat genètica existent entre individus de la mateixa espècie és també enorme. Si coneixeríem tot el genoma d'un individu i llegíem el d'un altre, trobaríem almenys un milió de nucleòtids diferents!
De gens (és a dir, un producte, p. ex. una proteïna, a part de les seqüències que formen una regla d'ebullició, apareixen seqüències que per a nosaltres no tenen significat. La falta de funció d'aquestes seqüències pot ser a vegades un avantatge, ja que poden tenir diferències entre l'individu i l'individu, per la qual cosa poden ser considerades com a marcadors específics d'individus. Entre aquestes seqüències es troben diverses seqüències denominades microsatèl·lits o SHORSTR (Short Tandem Repeat) formades per seqüències molt curtes (de 2, 3 o 4 nucleòtids) situades en el tandem (una successivament). Els STRs són molt polimòrfics (variables) pel que són molt útils en algunes aplicacions de la biologia de poblacions, com veurem més endavant.
El nostre equip compta amb una àmplia experiència en l'anàlisi i avaluació de la variabilitat genètica de les poblacions d'animals domèstics amb marcadors. De fet, per les característiques orogràfiques d'Euskal Herria, i per l'esforç realitzat pels baserritarras i ramaders d'aquí per mantenir les races autòctones, les races autòctones s'han mantingut durant segles en el nostre entorn. Tenim 15 races autòctones, 6 d'elles en perill i 7 en estat crític en conservació. D'altra banda, en algunes d'aquestes races, amb l'objectiu d'augmentar la seva producció, Hasle Elkartea està duent a terme Plans de Millora amb la col·laboració de les Diputacions i el Govern. Atès que tots els Plans de Millora estan basats en dades genealògiques i de producció, és imprescindible evitar errors genealògics que disminueixin la resposta a la selecció. Per tant, plantegem el desenvolupament d'un sistema genètic que serveixi en els Plans de Conservació i Millora de les nostres races, basat en marcadors genètics polimòrfics denominats STR.
La selecció de STRs per a dur a terme aquest treball pot explicar-se de manera senzilla. Aquestes seqüències curtes poden ser amplificades per PCR (Reacció encadenada de la polimerasa), obtenint un gran nombre d'aquestes seqüències a partir d'una petita quantitat d'ADN. Això facilitarà enormement totes les anàlisis posteriors. La tècnica PCR permet amplificar diverses STR simultàniament. Ens permet, per tant, l'accés simultani a la informació de les diferents regions del genoma (locus). A més, gràcies a la tecnologia desenvolupada en els últims anys, s'han desenvolupat aparells que permeten la detecció simultània de fragments d'ADN o al·lels marcats amb diferents fluorocromos (diferents seqüències d'individus en un locus determinat). En el nostre cas utilitzem un analitzador genètic denominat ABI-Prism 310, que realitza una electroforesi capil·lar per a la resolució dels diferents al·lels i que és capaç de detectar mitjançant làser diferents al·lels. Aquest aparell presenta els resultats de manera informatitzada. Tot això garanteix la velocitat, l'estandardització i, sobretot, la qualitat de les anàlisis.
Amb aquesta tecnologia punta pretenem desenvolupar un sistema d'alta definició mitjançant STR, buscant un control efectiu de la identitat dels animals. Això suposa sobretot un avantatge decisiu per a la determinació de la paternitat. Com s'ha comentat anteriorment, els STRs són molt variables (5-10 al·lels per locus) i la tecnologia utilitzada permet un estudi simultani de 11-12 locus. Per tant, tindrem una gran capacitat d'identificar genèticament als diferents individus i una manera d'afirmar amb gran probabilitat que un nen té un mascle com a pare. D'altra banda, serem capaços de quantificar la variabilitat de les poblacions integrades per aquests individus. Finalment, si comparem diferents poblacions, serem capaces d'analitzar les relacions entre elles, ja que aquest coneixement pot ser molt important per a conèixer la història evolutiva de les nostres races.
Pretenem, en la mesura que sigui possible, donar resposta a les necessitats dels ramaders amb els nostres serveis i que els nostres resultats serveixin per al desenvolupament del sector primari.
Zu idazle
Zientzia aldizkaria
