Identificación genética de animales domésticos
El genoma de los mamalios (conjunto de información genética que se coloca en las células) típico tiene 3.000 millones de pares de nucleótidos, organizados en una secuencia lineal y con un contenido informativo enorme. La variabilidad genética existente entre individuos de la misma especie es también enorme. Si conoceríamos todo el genoma de un individuo y leíamos el de otro, ¡encontraríamos al menos un millón de nucleótidos diferentes!
De genes (es decir, un producto, p. ej. una proteína, aparte de las secuencias que forman una regla de ebullición, aparecen secuencias que para nosotros no tienen significado. La falta de función de estas secuencias puede ser a veces una ventaja, ya que pueden tener diferencias entre el individuo y el individuo, por lo que pueden ser consideradas como marcadores específicos de individuos. Entre estas secuencias se encuentran varias secuencias denominadas microsatélites o SHORSTR (Short Tandem Repeat) formadas por secuencias muy cortas (de 2, 3 o 4 nucleótidos) situadas en el tandem (una sucesivamente). Los STRs son muy polimórficos (variables) por lo que son muy útiles en algunas aplicaciones de la biología de poblaciones, como veremos más adelante.
Nuestro equipo cuenta con una amplia experiencia en el análisis y evaluación de la variabilidad genética de las poblaciones de animales domésticos con marcadores. De hecho, por las características orográficas de Euskal Herria, y por el esfuerzo realizado por los baserritarras y ganaderos de aquí por mantener las razas autóctonas, las razas autóctonas se han mantenido durante siglos en nuestro entorno. Tenemos 15 razas autóctonas, 6 de ellas en peligro y 7 en estado crítico en conservación. Por otro lado, en algunas de estas razas, con el objetivo de aumentar su producción, Hasle Elkartea está llevando a cabo Planes de Mejora con la colaboración de las Diputaciones y el Gobierno. Dado que todos los Planes de Mejora están basados en datos genealógicos y de producción, es imprescindible evitar errores genealógicos que disminuyan la respuesta a la selección. Por tanto, planteamos el desarrollo de un sistema genético que sirva en los Planes de Conservación y Mejora de nuestras razas, basado en marcadores genéticos polimórficos denominados STR.
La selección de STRs para llevar a cabo este trabajo puede explicarse de forma sencilla. Estas secuencias cortas pueden ser amplificadas por PCR (Reacción encadenada de la polimerasa), obteniendo un gran número de estas secuencias a partir de una pequeña cantidad de ADN. Esto facilitará enormemente todos los análisis posteriores. La técnica PCR permite amplificar varias STR simultáneamente. Nos permite, por tanto, el acceso simultáneo a la información de las distintas regiones del genoma (locus). Además, gracias a la tecnología desarrollada en los últimos años, se han desarrollado aparatos que permiten la detección simultánea de fragmentos de ADN o alelos marcados con distintos fluorocromos (diferentes secuencias de individuos en un locus determinado). En nuestro caso utilizamos un analizador genético denominado ABI-Prism 310, que realiza una electroforesis capilar para la resolución de los diferentes alelos y que es capaz de detectar mediante láser diferentes alelos. Este aparato presenta los resultados de forma informatizada. Todo ello garantiza la velocidad, la estandarización y, sobre todo, la calidad de los análisis.
Con esta tecnología punta pretendemos desarrollar un sistema de alta definición mediante STR, buscando un control efectivo de la identidad de los animales. Esto supone sobre todo una ventaja decisiva para la determinación de la paternidad. Como se ha comentado anteriormente, los STRs son muy variables (5-10 alelos por locus) y la tecnología utilizada permite un estudio simultáneo de 11-12 locus. Por lo tanto, tendremos una gran capacidad de identificar genéticamente a los diferentes individuos y una forma de afirmar con gran probabilidad que un niño tiene un macho como padre. Por otro lado, seremos capaces de cuantificar la variabilidad de las poblaciones integradas por estos individuos. Por último, si comparamos distintas poblaciones, seremos capaces de analizar las relaciones entre ellas, ya que este conocimiento puede ser muy importante para conocer la historia evolutiva de nuestras razas.
Pretendemos, en la medida de lo posible, dar respuesta a las necesidades de los ganaderos con nuestros servicios y que nuestros resultados sirvan para el desarrollo del sector primario.
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