Una de les grans controvèrsies entorn dels aliments transgènics són els riscos de la propagació en la naturalesa dels gens manipulats.
El blat de moro transgènic del grup Novartis, per exemple, produeix una toxina antiárabe, però juntament amb el gen productor de toxina, també conté un gen anti-ampizilina, l'antibiòtic de la família de la penicil·lina. Aquest gen és un gen inactiu en el blat de moro, però si els bacteris l'assimilen i l'activen, pot estendre's fàcilment a animals i éssers humans, provocant una resistència a les malalties.
L'investigador britànic John Heritage ha estudiat com es transmet aquest gen de la planta al bacteri i del bacteri als pollastres i ha vist que el gen "nociu" no s'ha activat ni en bacteris ni en pollastres. Els resultats són provisionals i s'analitzen altres espècies animals