Se sabía que en 1347 se introdujo la peste negra al Mediterráneo a través de buques mercantes procedentes de la Horda de Oro. Se extendió por Europa, Oriente Medio y Norte de África y se estima que murió el 60% de la población. Le siguió la segunda ola del IXX. Duró hasta el siglo XX.
Ha habido muchas discusiones sobre el origen de esta segunda ola. Las únicas evidencias arqueológicas provienen de Asia Central, en las proximidades del lago Dei, por Issy, hoy en Kirguistán. De hecho, las excavaciones realizadas hace 140 años revelaron algunas tumbas de los 1338-1339, que fueron asesinadas por una plaga desconocida. Ahora se ha investigado el antiguo ADN de los restos de las tumbas que contenían estas inscripciones y se ha demostrado que la bacteria Yersinia pestis, causante de la plaga negra.
Los estudios genéticos previos llevaron a pensar que X y XIV. entre los siglos se produjo una gran diversificación de esta bacteria. Comparando estos datos con los obtenidos en la actualidad, afirman que la variante original de esta diversificación fue de 1338. Es decir, Y. pestis se diversifica y se expande a partir de aquí. Antes de esto, los investigadores también mencionan que estaría en depósitos. El trabajo ha sido publicado en la revista Nature.