Se sabia que en 1347 es va introduir la pesta negra al Mediterrani a través de vaixells mercants procedents de l'Horda d'Or. Es va estendre per Europa, Orient Mitjà i Nord d'Àfrica i s'estima que va morir el 60% de la població. Li va seguir la segona ona de l'IXX. Va durar fins al segle XX.
Hi ha hagut moltes discussions sobre l'origen d'aquesta segona ona. Les úniques evidències arqueològiques provenen d'Àsia Central, en les proximitats del llac Dei, per Issy, avui a Kirguizistan. De fet, les excavacions realitzades fa 140 anys van revelar algunes tombes dels 1338-1339, que van ser assassinades per una plaga desconeguda. Ara s'ha investigat l'antic ADN de les restes de les tombes que contenien aquestes inscripcions i s'ha demostrat que el bacteri Yersínia pestis, causant de la plaga negra.
Els estudis genètics previs van portar a pensar que X i XIV. entre els segles es va produir una gran diversificació d'aquest bacteri. Comparant aquestes dades amb els obtinguts en l'actualitat, afirmen que la variant original d'aquesta diversificació va ser de 1338. És a dir, I. pestis es diversifica i s'expandeix a partir d'aquí. Abans d'això, els investigadors també esmenten que estaria en dipòsits. El treball ha estat publicat en la revista Nature.