S'ha revelat l'evolució de la plaga bubónica en Euràsia des del Neolític, analitzant els antics genomes de Yersinia pestis, concretament 17. Aquests genomes han estat trobats en les dents de 252 individus que van viure en Euràsia fa 5000-2500 anys, entre ells un enterrat en el dolmen del Sotillo (Rioja Alabesa). Va ser enterrada fa uns 3.300 anys i és l'evidència més antiga de Yersinia pestis en la península.
El bacteri Yersinia pestis és causant de la plaga bubónica, per que en l'Edat del Bronze s'ha demostrat que ja existia aquesta malaltia, ja que l'home enterrat en El Sotillo va morir sota la pesta bubónica. A més, l'estudi genètic dels bacteris ha demostrat que hi havia dos ceps en Euràsia, que van estar simultàniament durant almenys 2.500 anys. Un d'ells es transmetia a través de les puces, que va perdurar el cep i va causar grans plagues molt més tard. En canvi, l'altre es va perdre en l'Edat del Ferro. Segons els investigadors, aquest cep perdut no es difonia a través de les puces, però no saben qui era l'animal que la feia.
Només dos dels genomes analitzats en l'estudi són ceps que es transmeten per puces: El Sotillo i Samara (Rússia). Aquesta última és 500 anys més jove que la del Sotillo, i la distància que separa aquests dos llocs (uns 5.000 km) deixa clar fins quin punt la pesta bubónica estava estesa.
El estudi , publicat en obert en la revista PNAS, conclou que els dos ceps de Yersinia pestis van evolucionar en paral·lel i probablement van abastar diferents nínxols ecològics. D'altra banda, expliquen que l'actual Yersinia pestis també pot ser transmès sense l'ajuda de puces, com per exemple, a través de les gotetes bucals, o a través de la carn o el menjar d'algun animal infectat, així com a través de la femta.
Tanmateix, tenen clar que les migracions i les estretes relacions interpersonals van tenir una gran importància en l'expansió dels vaquers i en la domesticació dels animals.