En analysant les déjections qui ressemblaient aux loups, deux chercheurs du Grupo Lobo de Euskadi et de la Station Biologique Doñana de Séville ont vu que les loups européens se nourrissent en grande partie de proies sauvages, tandis que les ovins ne se nourrissent que dans 3% des cas. Dans la plupart des cas, plus précisément dans 70% des cas, des chevreuils et des restes de sangliers ont été trouvés dans les selles des loups. Dans les déjections des chiens ont été trouvés des restes de moutons dans 36% des cas.
De grands prédateurs comme les loups ibériques colonisent à nouveau certaines zones des pays industrialisés. En fait, la limite orientale de la population du loup européen dans la péninsule ibérique se trouve au Pays basque, principalement en Alava. Dans cette zone, les moutons latxa sont les moutons les plus abondants. Les brebis sont souvent sans clôture et pas toujours sous la surveillance des bergers.
On rapporte souvent que ces moutons ont été attaqués, et un des chercheurs du Groupe Otso d'Euskadi, Jorge Echegaray, a dit que "95% de ces attaques sont imputées aux loups". Cela a provoqué des conflits entre paysans, gestionnaires et agences et groupes en faveur de la conservation des loups. Les loups sont très malfamés et subissent une grande persécution, "probablement injuste", affirme Echegaray.
Par exemple, selon les données officielles de la Diputación de Álava, en 2003-2004, 432 animaux ont été agressés et seulement 10 ont été accusés d'agression contre les chiens. Les chiens qui sont devenus sauvages et ne sont pas contrôlés sont habituels et, comme les loups, sont capables d'attaquer les animaux, en particulier les moutons. Mais on mesure rarement la responsabilité des chiens dans la prédation des animaux, entre autres, car il est techniquement difficile de déterminer ce qui a été le prédateur dans une agression particulière.
Les chercheurs ont montré que les méthodes génétiques sont un outil utile pour résoudre ce type de malentendus. Dans la recherche ont été recueillies 136 excréments qui à première vue ressemblaient à des loups européens. Les analyses réalisées dans l'ADN mitochondrial ont permis d'identifier l'animal d'origine de 86 excréments : 31 étaient des loups, 2 d'azérète et 53 de chiens.
En analysant les restes de proie qui se trouvaient dans les excréments de loups et de chiens, on a constaté que chaque excrément avait des restes d'une seule proie. Or, dans les déjections des loups, dans 27% des cas on a trouvé des restes d'animaux, mais seulement dans 3% des cas on observait des restes de brebis. Dans le reste, les loups se sont nourris à cheval et à boeuf. Dans les déjections canines, pour leur part, des restes de brebis ont été trouvés dans 36% des cas et, en général, dans 54% des déjections canines, les captures ont été gagnantes.
Au vu de ces résultats, Echegaray soutient que la Députation devrait remettre en question si « le nombre d'attaques qui accusent les loups est correct », ce qui devrait servir à « concevoir correctement les programmes de prévention et de paiement » et à réduire le conflit entre les prédateurs naturels et la société.