Présentation du projet de l'hologénome de la Terre
Ils présentent le Projet de l'hologénome de la Terre, une collaboration mondiale pour la collecte et l'analyse de données hologénomiques d'animaux sauvages et de micro-organismes associés. L'objectif est de revoir l'écologie et l'évolution d'un point de vue systémique des interactions ostental-microbiote. EHI (Earth Hologenome Initiative) a été présenté dans la revue Trends in Ecology and Evolution.
La plupart des animaux terrestres vivent en étroite interaction avec les micro-organismes, qui influent sur de nombreux processus biologiques, tant sur l'hôte que sur les micro-organismes et sur le milieu. La technologie actuelle permet une caractérisation détaillée des génomes et métagénomes microbiens des hôteliers. C’est ce qu’on appelle Hologénomique et offre de nombreuses possibilités pour analyser l’influence des interactions ostental-microbiote sur des processus clés tels que la spéciation, l’adaptation au changement climatique, la transmission des maladies…
« Il n’y avait pas d’infrastructure pour analyser systématiquement les interactions entre les animaux et les micro-organismes », explique Antton Alberdi Estibaritz, professeur et chercheur à l’Université de Copenhague et coordinateur du projet EHI. « Chaque chercheur crée généralement des projets à petite échelle en utilisant ses propres procédures. Bien qu’il soit approprié à petite échelle, cela pose de grandes difficultés pour réaliser des comparaisons entre projets et espèces, notamment en raison du risque élevé de biais techniques du processus de production de données moléculaires de micro-organismes. »
Alberdi a indiqué plus de raisons de lancer le projet : « Nous voulons créer des méthodologies de qualité, ouvertes et peu coûteuses, qui rendent les analyses moléculaires plus accessibles. La plupart des scientifiques utilisent des kits commerciaux, mais dans de nombreux cas, ils ne sont pas disponibles partout dans le monde, et les grands projets peuvent avoir des difficultés de reproduction s'ils basent leurs processus sur des solutions commerciales. Si la société décide de changer de produit, elle aura la possibilité de produire des données comparables. »
Et enfin, ils veulent qu'il serve à créer une communauté. « EHI est également une plateforme de collaboration entre chercheurs du monde entier, encourageant la participation directe des chercheurs locaux, encourageant l’utilisation éthique des ressources génétiques et créant des opportunités de collaboration », explique M. Alberdi.
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