La pénurie de pluies n'était pas un danger, mais l'eau des lacs était utilisée pour alimenter le fleuve Mississippi. Les changements d'eau souhaités par certaines organisations des États-Unis ont été suspendus à la suite des protestations et des problèmes écologiques disproportionnés qui pourraient surgir du gouvernement canadien.
Au sud de Chicago, un canal relie l'Illinois, branche du Mississippi, avec le lac Michigan. L'idée était qu'avec ce canal, 280 m 3 par seconde sortait du lac Michigan. Si le projet allait de l'avant, la taille de l'Illinois aurait doublé et le niveau du Mississippi augmenterait de 10 cm dans le Memphis du Tennessee. Puis, le niveau d'eau de Memphis était 8 mètres au-dessous de la normale. Depuis 1872, c'était le niveau d'eau le plus bas.
Le fleuve Mississippi et ses affluents jouent un rôle important dans l'économie américaine grâce au transport fluvial. À la mi-juillet, seulement la moitié des rivières du Mississippi et de l'Illinois pouvaient être consacrées au trafic naval et dans de nombreuses branches le trafic était impossible.
Son influence sur les Grands Lacs n'est pas très claire, mais on pense que le niveau d'eau du Huron et du Michigan pouvait baisser de deux cm en trois mois. Cependant, l'effet de la diminution du niveau de l'eau se produirait surtout à proximité des lacs. Les écosystèmes des terres humides proches du lac pouvaient avoir un fort impact. Pas seulement au niveau écologique. L'approvisionnement en eau pour 26 millions de personnes vivant à proximité du lac et obtenant leurs eaux du lac aurait également été menacé. Cependant, le plus gros problème est que connaître à l'avance les risques et les conséquences réelles d'un travail de ces caractéristiques est très difficile.
Cette fois-ci, l'expulsion des Grands Lacs a été évitée, mais les Canadiens savent qu'à l'avenir il y aura plus de controverse de ce type, puisque les modélisations de l'effet de serre indiquent que le centre des États-Unis deviendra plus sec.