Les chercheurs de l'UPV/EHU décodent le transcripteur du korrokoi
Le groupe de recherche Biologie Cellulaire en Toxicologie Environnementale du Département de Zoologie et Biologie Cellulaire de l’UPV/EHU vient de décoder la transcription du coco. Transcriptome est la partie transcrite ou lue du génome. Dans la plupart des êtres multicellulaires se trouve environ 1,5% du génome.
Pour mener à bien ce travail de recherche, les chercheurs de l'UPV/EHU ont capturé à Ondarroa plusieurs exemplaires de korrocoya. Plusieurs organes, tels que le foie, les branchies, les gonades, le cerveau, etc., ont été séparés de chaque exemplaire, dont l'ARN messager a été extrait. Ensuite, tout le messager ARN est devenu ADN supplémentaire (cADN).
Tous ces ADN supplémentaires ont été envoyés au service de séquençage de l'Université de Newcastle. En fait, ils ont un nouveau système de séquençage, très rapide et efficace. Ainsi, l'équipe de recherche de l'UPV a obtenu toutes les informations de la transcriptrice de noix de coco, 126 millions de nucléotides.
"Puis vient le travail le plus fatigué. Donner un sens à toutes ces informations. C'est-à-dire examiner quel genre correspond chaque séquence », affirme Ibon Cancio, directeur du projet.
"Nous avons acquis des parties de 18.332 gènes. Ce ne sont pas tous les gènes du corridor, mais plus de la moitié », ajoute Cancio. Avec toutes ces informations, ils ont développé une puce d'ADN qui permet d'étudier comment le niveau d'expression de tous ces gènes est modifié face à la contamination.
L'équipe de chercheurs de l'UPV-EHU espère décoder la transcription de la rate l'année prochaine pour connaître l'état de santé des sols.
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