L'ADN pot organitzar-se de manera natural, formant nanoestructuras ben definides. Aquesta característica pot ser utilitzada per a la realització de dispositius microscòpics o per a l'estructuració del material directament a una escala inferior al micròmetre.
Els científics han tingut problemes per a clonar objectes d'ADN tridimensional, ja que les polimeras impedien la còpia. Però no és el cas de l'octaedre que apareix en la nanoescala. Aquesta molècula adopta la forma d'un octaedre regular enfront dels oligonucleótidos, de 22 nanòmetres de diàmetre que han pogut ser dissenyats específicament. Això augmenta les possibilitats d'ús en nanotecnologia.
Per a aconseguir-ho, a més, una característica fonamental de l'ADN, l'amplificació mitjançant polimerasa, serà de gran ajuda. Aquesta amplificació facilita la producció de grans dimensions i l'evolució guiada de les seqüències.