Segons alguns investigadors australians, el secret del color dels ulls està en la regulació dels gens. No hi ha gènere que defineixi el color, sinó un que s'encarrega de crear el pigment. Aquest gen canvia el color de l'ull amb major o menor expressió, per la qual cosa el color dels ulls ve determinat pel punt de control del gen. És a dir, el color dels ulls ve determinat per una petita seqüència de bases de l'ADN molecular que no es troba dins del gen.
Aquesta petita seqüència varia d'una persona a una altra. La gent que activa molt el gen produeix molt pigment i té ulls marrons, mentre que qui l'activa poc produeix poc pigment i té ulls blaus. Els ulls verds són especials: un altre petit canvi en el genoma fa que el pigment sigui de tonalitat verda i no de color blau.
El gen del pigment, denominat OCA2, també actua sobre la pell i el cabell. De fet, els qui tenen el gen completament silenciat són persones albines.