En la majoria dels casos, no obstant això, la pròpia naturalesa estressa les plantes. La quantitat de llum, font d'energia en condicions normals, es transforma en excés a l'hivern (a causa del fred) i a l'estiu (a causa d'altes temperatures i sequeres), ja que el metabolisme de les plantes no pot absorbir adequadament. Aquest procés es denomina estrès de fotooxidación.
Algunes plantes són incapaces de suportar aquest estrès. Al no poder dispersar adequadament l'excés d'energia, produeixen una reacció en cadena que es va deteriorant progressivament fins a la seva mort. Altres espècies, per part seva, inicien un procés de climatització i activen compostos químics d'autoprotecció, és a dir, s'adapten a la nova situació. Aquests compostos químics són d'interès per a un grup d'investigadors del Departament de Biologia Vegetal i Ecologia de la Facultat de Ciència i Tecnologia de la UPV/EHU.
El grup EKOFISKO, liderat pel doctor Txema Becerril, investiga els mecanismes de protecció de les plantes per a detectar-los abans que es produeixin els danys. Mesuren les substancies foto-protectores que produeixen les plantes i analitzen el seu comportament utilitzant com biosensores de l'estrès de fotooxidación.
Entre les plantes s'analitzen els arbres i la resta d'espècies forestals. De fet, en tractar-se d'espècies de cicle llarg, s'ha d'assegurar la seva adequada adaptació al mitjà abans d'iniciar les labors de reforestació. Investiguen les espècies autòctones de la Comunitat Autònoma del País Basc, especialment les del Sud, que es troben a la frontera entre el clima atlàntic i el mediterrani, per la qual cosa són elles les que sofririen els primers danys davant el canvi climàtic. Estudien espècies amb fulles caduques i persistents que s'adapten a temperatures fredes sense perdre la fulla.
Per a mesurar els biomarcadores de l'estrès de fotooxidación, simulen les condicions d'hivern i estiu en l'hivernacle de la Facultat de Ciència i Tecnologia i en les cambres de cultiu, és a dir, afecten artificialment les plantes les condicions d'aquestes estacions. Així, només analitzen les conseqüències de cada agent d'estrès, al marge de la resta de variables que es poden trobar en la naturalesa.
Investigadors de la UPV han demostrat que el secret de les espècies adaptatives és l'acumulació d'antioxidants, com la vitamina E i els carotenoides especials (carotenos i xantofilas), substàncies que alteren el color de les plantes. Quan reben massa llum, les plantes posen en marxa el cicle VAZ: l'equilibri entre les tres xantofilas corresponents a aquests tres inicials canvia perquè aquesta energia excessiva no danyi a les plantes. A més d'investigar el cicle VAZ, l'equip de Txema Becerril (cicle de la luteina epoxi) ha trobat un cicle que fins ara no es coneixia. Aquest cicle està present en moltes espècies forestals, com l'hi hagi, el llorer, encara el roure, i ara s'està investigant la seva funció protectora.