L'infection des voies urinaires est un problème majeur de santé publique par sa grande influence sur la population, étant plus fréquente chez les femmes que chez les hommes.
En réalité, le tractus urinaire est stérile, c'est-à-dire sans micro-organismes, bien que parfois les micro-organismes colonisent ce tractus et provoquent des infections chez l'homme. Le diagnostic de l'infection urinaire consiste en l'étude de l'urine et le nombre de micro-organismes. Si le résultat du comptage est égal ou supérieur à 105 micro-organismes par millilitre, l'infection du patient est assurée.
En général, l'infection urinaire peut être classé en trois types: bactériurie sans symptômes, infection des voies inférieures et infection des voies supérieures. Le premier est très commun et le patient n'est pas conscient de l'infection, car il souffre sans symptômes. Les infections des voies inférieures sont appelées cystite et sont également très fréquentes; leur incidence est exclusive dans la vessie et présentent généralement des symptômes bénins. Les infections des voies supérieures, au contraire, affectent les reins et sont beaucoup plus graves. Ils sont appelés pyélonéphrite et les cas de ces infections sont mineurs.
Les infections urinaires peuvent être causées par différents micro-organismes, mais dans la plupart des cas, à la fois à l'intérieur et à l'extérieur de l'hôpital, la bactérie Escherichia coli est responsable des infections urinaires qui sont reçues. Ce micro-organisme vit dans l'intestin humain dans le cadre de sa flore normale, avec un rôle important dans le maintien de l'état physiologique de l'intestin. En revanche, certaines des souches de cette espèce Escherichia coli sont devenues pathogènes, c'est-à-dire capables de produire une infection, tant intestinale qu'extracentro, les infections urinaires les plus importantes étant les plus importantes.
Dans la plupart des cas, les souches E. coli isolées dans les infections urinaires présentent des caractéristiques particulières par rapport aux souches intestinales, les facteurs de virulence étant ceux qui déterminent l'uropathogénie de ces bactéries. Un des facteurs de virulence les plus importants des souches uropatogènes E. coli sont les poils P. En raison de l'anatomie des voies urinaires, il est évident que les bactéries provenant de l'extérieur doivent être élevées pour provoquer une infection de la vessie et des reins. Toute caractéristique contribuant à cette augmentation deviendra un facteur important de virulence car elle facilitera la colonisation des voies urinaires pour ces souches pathogènes. La fonction des poils P des souches E. coli est de fixer l'adhésion bactérienne dans les voies urinaires afin que le déversement de l'urine n'expulse pas les bactéries et peut continuer à augmenter. Cependant, bien qu'étant les plus importants, les poils P ne sont pas les seuls facteurs de virulence des uropatogènes E. coli. D'autres sont des hémolysines capables de détruire les cellules sanguines, l'enzyme aerobactine qui facilite l'assimilation du fer léger, la résistance aux antibiotiques, les antigènes K encapsulés, etc.
L'objectif de ce groupe de recherche au cours des dix dernières années a été d'analyser les facteurs de virulence des bactéries Escherichia coli. Les facteurs de virulence qui aident les bactéries à retenir l'épithélium des voies urinaires ont été étudiés, y compris les cheveux dits P. On a également étudié l'utilité de certains antibiotiques qui peuvent influencer la synthèse de ces cheveux, comme l'effet des quinolones sur l'inhibition de la synthèse des poils P. Les quinolones, utilisées dans des concentrations subinhibitoires, évitent la synthèse des poils P d'E.coli, empêchant l'adhésion des bactéries (voir photo). Par conséquent, il a été prouvé que l'utilisation de ces antibiotiques comme mesure préventive dans les groupes de personnes à risque d'infection urinaire dans la population est une option intéressante.
Au cours des dernières années, la progression du reste des sciences et, surtout, les technologies ont changé les techniques utilisées dans la recherche de l'infection urinaire. Bien qu'au début nous utilisions principalement des techniques phénotypiques pour étudier les caractéristiques des souches E.coli qui produisaient des infections urinaires, il y a déjà six ans où nous cherchons de nouvelles applications des techniques génotypiques dans la recherche de l'infection urinaire. Par exemple, nous avons adapté une technique génotypique basée sur le PCR (Polymerase Chain Reaction) pour détecter de manière agile et simple la plupart des facteurs de virulence bactérienne isolés d'urine infectée dans un même test. Cette ligne de travail décrit la méthode de détection directe des facteurs de virulence de E. coli dans l'urine des patients pour éviter l'isolement bactérien. S'il est possible d'utiliser cette méthode dans le travail habituel dans les centres de santé, nous améliorerions la connaissance des infections urinaires qui se produisent sur notre territoire, ainsi que des mesures préventives.