Comme le carbonate calcique des calcaires et le sulfate calcique des plâtres se dissolvent avec de l'eau, dans les formations géologiques dominées par ce type de roches, par le procédé appelé karstification, l'intérieur est rempli de tubes et de forages. Sur ces routes souterraines l'eau se déplace à grande vitesse et tout en se déplaçant continue avec la dissolution de pierres, l'augmentation des canaux et la charge de sel. Le processus laisse des indications sur la surface terrestre de drains sous forme d'entonnoir, connus sous le nom de dolines, sources, cendres, simas, osines, etc. qui apparaissent dans des endroits inattendus. Beaucoup des zones humides, lagunes et étangs du Pays Basque ont été créés par des processus de karstification.
Les argiles de décalcification qui laissent les calcaires dissous comme restes se sont formées quand les fonds des dolines sont imperméabilisés. Si les dolines qui abritent ces zones humides proviennent des zones hautes des sierras par dissolution du calcaire (dolines de dissolution), les zones humides sont généralement approvisionnées uniquement en eau de ruissellement, elles sont généralement de très petite taille et leurs marges ne sont pas très abruptes. Si les dolines sont la conséquence de l'érosion de l'eau souterraine, de la chute des couches supérieures (effondrements), en plus d'avoir une plus grande profondeur et des arêtes plus raides, ce sont des zones humides normalement pourvues d'eau froide.
Dans les régions calcaires, même où l'eau sort par le sous-sol, suite à la dissolution, des dépressions peuvent apparaître. Une fois ces dépressions remplies avec l'eau mentionnée, on peut développer des étangs ou des lagunes karstiques. Ce sont aussi des zones humides karstiques associées à des rivières qui traversent des zones calcaires. Dans ces cas, alors que la dissolution augmente la profondeur du lit, la précipitation des carbonates dissous peut former des accumulations diocésaines (glissières) et le long des vallées beaucoup de lagunes karstiques apparaissent ci-dessous.
Cependant, d'autres zones humides karstiques apparaissent dans des dépressions qui se forment dans des structures géologiques appelées diapyrus. Les diapiros sont des structures géologiques en forme de dôme constituées principalement par des plâtres, des marnes et des argiles du Triasique. En raison de la plasticité élevée et de la faible densité de ces matériaux, ils percent ou soulèvent des couches géologiques de type tertiaire. Par conséquent, les matériaux les plus anciens apparaissent avec les plus jeunes ou les plus anciens sur les jeunes. Ainsi se forment des structures géologiques vraiment curieuses. Les pierres qui forment les diapyros sont molles et facilement érodées. C'est pourquoi, dans les zones à diapiros, on crée souvent des dépressions. Dans la plupart des cas, ces dépressions coupent les niveaux freatiques de la zone et affleurent les eaux souterraines, entraînant l'apparition de mares et parfois de lacs. En raison des caractéristiques de ces structures géologiques, elles sont souvent associées à des sources salines, de sorte que beaucoup des salines qui sont exploitées au Pays Basque ou qui ont été exploitées à l'occasion se trouvent dans des endroits où apparaissent les diapiros (par exemple, les salines de Salinas de Añana de Álava ou les salines de Jaitz ou Arteta de Navarra).
Tant les zones humides qui ne reçoivent que de l'eau de ruissellement, que celles qui reçoivent des eaux souterraines, ont des eaux assez oligotrophiques. Dans les premiers, l'eau effectue des parcours très courts avant d'arriver à la zone humide, ce qui provoque que l'eau présente peu de nutriments minéraux. Dans les secondes, cependant, après avoir traversé des pierres solubles sous le sol, les eaux atteignent la zone humide assez minéralisée. Dans ce type d'eau abondent carbonates, sulfates, calcium et magnésium. Dans une moindre proportion apparaissent chlorures et sodium. Cependant, dans ces cas, l'abondance de calcium provoque non seulement l'alcaline de l'eau, mais aussi le phosphore se précipite, de sorte qu'ils contiennent généralement des eaux transparentes de faible production, oxygénées, froides et oligotrophiques.
Bien qu'il s'agisse d'environnements de faible production, ils présentent parfois un haut degré d'organisation et de complexité, surtout ceux qui ont des eaux profondes et des débits souterrains, où nous trouvons des communautés isolées et surprenantes de moyens et d'êtres vivants. Parmi eux, les communautés de procaryotes capables de réaliser la photosynthèse sans oxygène, qui vivent dans des eaux profondes riches en plâtre. Ils sont des témoins vivants des premières étapes de l'histoire de la vie. Cependant, l'objet de ce travail sont les zones humides et les zones d'eau profonde ne peuvent pas être reconnues comme zones humides, de sorte qu'il ne sera plus approfondi sur cet aspect et ne sera considéré que les zones humides qui se développent habituellement en bordure des systèmes d'eau profonde.
La diversité des origines géologiques des zones humides karstiques fait qu'il existe de nombreux exemples de profondeurs, de dimensions, d'aspect de la cuvette et d'inclinaison de leurs marges très différentes. A cette diversité géologique il faut ajouter la diversité climatique que nous trouvons en Euskal Herria, étant situé entre la région bioclimatique eurosibérienne et méditerranéenne, avec une remarquable différence d'altitude et avec des conditions météorologiques relativement différentes en petits tronçons. Outre la diversité de végétation associée aux nombreuses conditions climatiques, la végétation aquatique prédomine dans les zones humides karstiques à marges peu profondes et avec de fortes pentes, tandis que dans celles qui présentent des marges de grande profondeur mais avec des pentes douces, la végétation la plus importante est celle des roselières et des roselières. Parmi ces deux types de modèles, il existe de nombreux exemples intermédiaires. En ce qui concerne la végétation, on peut dire qu'au Pays Basque les zones humides karstiques associées aux diapiros sont plus riches. Le reste, en plus d'être plus petit, se trouve normalement à proximité des montagnes, ce qui les oblige à supporter des conditions météorologiques plus sévères, ce qui a un impact direct sur les communautés végétales et animales locales.
Dans les plantes aquatiques sont fréquentes les espèces vasculaires Pomatogeton coloratus, Miriophyllum verticilatum, Elodea canadensis, Groenland dense ou Ceratophyllum demersum. Les algues carophites des genres Chara et Nitella sont également abondantes.
Dans les cas où la pente des bords est faible, les rails sont formés. Lorsque ces roselières s'étendent largement dans les zones humides, on peut distinguer deux zones principales : l'intérieur du roselier qui se développe à une plus grande profondeur d'eau et l'extérieur du roselier qui apparaît à peu de profondeur. Dans la première, les plantes les plus abondantes sont Cladium mariscus et Scirpus lacustris, tandis que dans la seconde prédominent Phragmatis australis et Tipha angustifolia.
Derrière les rails, dans des zones où l'humidité du sol est élevée sans être submergée, apparaissent généralement des roseaux formés par des espèces des genres Scirpus et Juncus.
En raison de l'abondance des zones humides karstiques et des différentes conditions climatiques des régions où elles apparaissent, il est très difficile de parler de la faune en général.
D'une part, il convient de noter que les arêtes raides que nous trouvons dans la plupart de ces zones humides limitent considérablement la possibilité de vivre des communautés benthiques. Parmi les modèles pour vivre dans ces conditions se trouvent des espèces de crustacés, mollusques, nématodes et oligoquètes, ainsi que des larves de différentes espèces d'insectes. Pour ses concentrations élevées, le bivalve Unio pictorum qui habite des fonds peu profonds se distingue. Parce qu'il n'a aucun problème à obtenir le calcium dont vous avez besoin pour construire la coquille.
Sur les rives, cependant, la faune est plus riche. Aux communautés prospères d'invertébrés composés de divers insectes, mollusques et crustacés, il faut ajouter une importante représentation des amphibiens. Parmi les invertébrés, on peut citer l'amphipode Gammarus pungens et le décapode Atyaephyra desmarestii. Quant aux amphibiens, dans les zones humides karstiques dispersées par la géographie du Pays Basque, on peut observer de nombreuses espèces d'amphibiens, en particulier pendant la période de reproduction, où tous les amphibiens se dirigent vers l'eau.
Parmi les amphibiens que nous pouvons trouver dans nos zones humides karstiques se trouvent le triton pâle, le triton marmolaire, la fonte commune, la grenouille commune, la grenouille sauvage rouge, la grenouille agile, la grenouille agile, la grenouille arborée commune, le txantxikua, le crapaud peint, le crapaud commun, le crapaud...
En ce qui concerne l'ornitophauna, les faibles concentrations de nutriments et la petite taille de la plupart des zones humides, ainsi que les marges sans végétation dense, font qu'il n'existe pas de communauté abondante d'oiseaux. Cependant, dans les zones à grande surface d'eau et de rails structurés et compacts, il n'est pas difficile d'observer certaines espèces d'oiseaux adaptées à la vie dans les écosystèmes aquatiques. Espèces migratrices dans la plupart des cas
Ils sont prêtres, mais on peut s'assurer qu'ils nidifient dans certaines zones humides karstiques. Dans les eaux ouvertes sont fréquentes les anatides (canards, cercettes, plongeurs), les podizipediformes (porras et brins) et les rappels, comme les coquetazos. Cependant, sur les rails des rivages, il y a des raids comme des rails, des benarrignes, des verdures de marais ou des poules d'eau et des poules d'eau.