L'illa de Nova Guinea depèn de dos estats. En la part occidental, Irian-Jaya, envia Indonèsia, que els seus papúes corren cada vegada majors riscos de supervivència. Les sagnants revoltes que han dut a terme centenars d'aborígens armats en la capital de Jayapura són una mostra de malestar, ja que els indonesianos exilien o assassinen als seus habitants.
El seu principal enemic és l'exèrcit indonesi. L'Església catòlica ha publicat un informe en el qual explica els abusos comesos pels soldats. El Govern d'Indonèsia ha venut nombroses concessions a les companyies de mineria i fusteria de l'oest i els militars s'han convertit en mercenaris d'aquestes. Als Estats Units, per exemple, la companyia Freeport explota la major mina d'or del món en el territori anomenat Timika i contamina 50 km² al voltant de la mina.
Una altra de les amenaces dels papus és la immigració dels javatarras. L'excés de població a l'illa principal de l'Arxipèlag fa que s'acostin a Irian-Jaya. Però a causa de la immigració, els roben les terres i són inesmenables entre cultures diferents. Els javatarras, per exemple, són musulmans i tenen prohibida l'alimentació del porc. En la cultura dels papos, no obstant això, el porc és la principal font d'alimentació i és utilitzat per a l'intercanvi.