Els caimans estan desapareixent dels llacs i rius del Brasil. Un exhaustiu estudi sobre aquests animals explica que la caça, la mineria de l'or i el desenvolupament industrial són els responsables de la destrucció d'aquests rèptils. Molts dels caimans brasilers, a més, tenen plom en el teixit muscular, molt perillós per a la seva salut.
La revista Amphibia-Reptilia ha publicat dades preocupants. Les 47 zones en les quals vivia el caiman negre en terres amazòniques han desaparegut en 41. La situació del caiman comú no és greu, ja que de les 39 zones només ha desaparegut quatre. La regió més preocupant de l'Amazonía és la de Rondonia (al costat de Bolívia), on existeixen nombroses dificultats per a la supervivència d'aquests animals.
Segons els investigadors, la població de caiman no està totalment perduda, però caldrà prendre mesures, limitar la caça per a evitar la destrucció dels hàbitats naturals i utilitzar noves tecnologies per a reduir la contaminació industrial i minera.