A súa fonte podería ser as reaccións nucleares que se producen na atmosfera e o incentivo á propagación dos raios.
As explosións de raios gamma, que se producen tras os microsegundos dos raios, eran xa coñecidas. Os raios teñen millóns de voltios e crean grandes campos eléctricos no ceo. Os campos aceleran os electróns, os cales chocan fortemente contra os átomos e libéranse os raios gamma.
Agora, con todo, atoparon raios que veñen máis atrasados. Este atraso pode ser duns minutos ou dunhas horas, o que parece indicar que proceden das reaccións nucleares da atmosfera. Con todo, non saben como se producen estas reaccións. Moitos creen que os protones, acelerados como os electróns e chocando con elementos comúns na atmosfera, poden provocar reaccións en cadea.
En calquera caso, non está claro que os raios teñan a enerxía suficiente paira pór protones en marcha, nin que átomos producen os raios gamma.