El sistema operativo más utilizado es el DOS, tanto en los PCs como en los modelos más simples de la familia PS/2. El DOS 4.0 consta de 30 nuevas funcionalidades y es totalmente compatible con versiones anteriores, es decir, los usuarios tendrán a su disposición todos los comandos y opciones de las versiones anteriores.
Una de las características principales de esta nueva versión es la interface gráfica controlada por menú, que facilita el trabajo a quienes no tienen costumbre de utilizar la DOSA. También cuenta con un organizador de ficheros y seleccionador de aplicaciones, pero los usuarios experimentados también podrán utilizar la línea de comandos tradicional si lo desean. Por otra parte, el disco duro de más de 32 Mbytes puede ser manipulado sin partición, lo que supone la creación de un fichero que abarque todo el espacio del disco duro.
Las versiones anteriores tenían un límite de 32 Mbytes.
El procedimiento de instalación es más sencillo y los mensajes de error que ofrece son más representativos que en versiones anteriores.