Després de la captura del primer exemplar pels pescadors de les illes Comores, el celacanto viu en perill. Es tracta d'un dels pocs fòssils que sobreviuen i, a més de curiós, és la clau perquè els vertebrats puguin comprendre el moment en el qual van abandonar la mar i es van dirigir a la terra.
La primera notícia del celacanto data de 1938. Va ser llavors quan es va veure per primera vegada l'animal que durant segles ha viscut als voltants de les illes Comores. Des de llavors, la població de celacantos ha anat disminuint constantment. Segons les últimes dades, a mitja dotzena ja no arriben. La pesca és el principal enemic d'aquests animals. A pesar que als pescadors dels comores se'ls va prohibir la captura del celacanto, l'escassetat de la resta d'espècies els ha portat en els últims anys.
Les organitzacions ecologistes han sol·licitat mesures especials per a assegurar la supervivència d'aquest bell animal. Entre ells, el més important és crear i fer respectar les zones de protecció. A més, s'ha sol·licitat la creació de zones pesqueres fos de les zones en les quals viu el celacanto, la qual cosa faria front als pescadors. Per a conscienciar al públic del problema, instal·laran càmeres submarines. Això permetrà conèixer de prop el celacanto.