Nanotecnoloxía, microsistemas e wireless, liñas de investigación que priorizarán nos próximos anos o CEIT de Donostia. Paralelamente, e de face ao futuro, o reto de que a nova sede do CEIT estea terminada paira o ano 2003. Esta sede situarase no parque tecnolóxico de Miramón, onde se situarán laboratorios de investigación en tecnoloxías da información, laboratorios de microelectrónica e a sede social do Centro de Investigación de Microsistemas.
Estas intencións déronse a coñecer na memoria do CEIT do ano 2000. Os ingresos deste centro de investigación, 7,02 millóns de euros, creceron un 4,56% respecto de 1999. Por outra banda, produciuse un cambio na dirección do centro, xa que Afasto Avello substituíu a Manuel Fontes.