El llop ibèric no està en perill d'extinció, però, segons un estudi realitzat per experts de la Universitat Autònoma de Barcelona i de l'Estació Biològica de Doñana, pot arribar a estar en perill degut a l'escassa diversitat genètica dels grups de llops.
És cert que la població de llop ha augmentat en els últims anys. En la dècada dels 60 i 70 va tenir un mínim, els experts calculen que llavors vivien 500 individus i posteriorment el número ha augmentat. En l'actualitat s'estima que hi ha al voltant de 2.000 llops ibèrics. No obstant això, els biòlegs estan preocupats perquè per a sobreviure en el futur, a més de tenir molts exemplars, totes les espècies han de tenir diversitat genètica. Quan les poblacions estan aïllades, sense possibilitat de creuar-se entre si, no es produeix l'intercanvi de material genètic, la qual cosa provoca problemes endogàmics.
Experts de la Universitat Autònoma de Barcelona i de l'Estació Biològica de Doñana repoblan el llop ibèric. han analitzat el declivi que ha sofert al llarg de tot el segle, i amb això han realitzat estudis genètics dels grups de llops actuals. Segons ells, la situació del llop va ser pitjor del que es preveu en els anys 60 i 70, per la qual cosa avui dia presenten una diversitat genètica molt reduïda. El grup també ha investigat als llops russos i ha comprovat que les seves poblacions no han sofert el mateix declivi que les d'aquí i que la seva diversitat genètica és millor. I malgrat això, els grups de llops locals també estan bastant aïllats i a llarg termini poden tenir problemes genètics.