Diverses recerques han descobert que els bacteris intestinals protegeixen als hostes enfront de diverses malalties
Eviten la grip, protegeixen als ratolins del bacteri que els produeix inflamació i diarrea fins a la seva mort, i eviten el desenvolupament de la malaltia de kwashiorkor que provoca distròfia i desnutrició greu a nens amb una alimentació insuficient i inadequada. En tres recerques independents s'han aconseguit aquestes tres conclusions sobre l'impacte dels bacteris intestinals en els hostalers.
En la Universitat de Yale es va estudiar la influència dels bacteris intestinals en el risc de la grip. L'estudi es va realitzar amb dos tipus de ratolí, uns amb comunitat bacteriana pròpia i uns altres amb antibiòtics per a eliminar els bacteris intestinals. Doncs bé, van observar que els ratolins tractats amb antibiòtics tenien una major propensió a la grip.
Els investigadors han explicat que els bacteris intestinals activen alguns complexos proteics del sistema immunitari, els inflamasomas. I com a conseqüència d'una cadena de reaccions que posen en marxa els inflamasomas, les cèl·lules dendríticas comencen a atacar el virus de la grip. En els ratolins que tenien destruïdes els bacteris intestinals no es va produir l'activació dels agents inflamatoris ni la cadena de reacció posterior.
En un altre estudi realitzat amb els ratolins en la Universitat British Columbia, es va analitzar si els bacteris intestinals protegien la infecció per Citrobacter rodentium. De fet, els investigadors sabien que aquesta infecció provoca la mort d'uns ratolins i uns altres no. Per a provar si la diferència entre tots dos tipus de ratolí estava en els bacteris intestinals, els ratolins sensibles a la malaltia van ser primer destruïts per tots els bacteris intestinals. Posteriorment es van alimentar amb la femta dels ratolins resistents i es van veure resistents a la malaltia durant aproximadament un mes. S'ha explicat que els bacteris dels ratolins resistents provoquen l'augment del missatger IL-22 del sistema immunitari. No obstant això, en la inhibició d'aquest missatger, els ratolí van tenir una major tendència a morir per diarrees.
Finalment, un estudi de la Universitat de Washington revela que el desenvolupament o no de la malaltia de kwashiorkor implica el desenvolupament de l'una o l'altra comunitat de bacteris intestinals en nens amb una alimentació escassa i inadequada. En aquest cas, 317 parelles de bessons de Malawi van ser seguides fins als tres anys del seu naixement. Només en el 7% dels casos es va detectar que les dues bessones havien desenvolupat la malaltia, mentre que en el 50% dels casos només una de les dues bessones va tenir la malaltia kwashiorkor.
Com creien que eren els bacteris intestinals responsables d'aquesta diferència, es va procedir a l'eliminació de les comunitats bacterianes i a la seva substitució per les comunitats d'alguns d'aquests bessons. Els van donar els aliments que mengen els nens (90% farina de blat de moro i 10% hortalisses) i van veure que els ratolins que tenien bacteris intestinals de nens amb kwashioroso havien perdut més pes que els altres. Per contra, als països en desenvolupament, en alimentar-se amb el preparat habitual per a nens desnodrits, van obtenir un resultat negatiu.
Investigadors de la Universitat de Washington han afirmat que amb això no es dóna "per provat" que els bacteris intestinals siguin les úniques responsables de la malaltia de kwashiorkor, però que tenen certa influència.