En aquest moment en el qual s'ha llançat el microordinador Compaq 386 i en el qual s'espera a curt termini la presentació d'altres màquines basades en el microprocessador 80386, s'han suscitat grans incerteses sobre el futur sistema operatiu i, com és sabut, es mantindran els dubtes fins que l'IBM no aclareixi les seves intencions.
No obstant això, és clar que el sistema operatiu DOS 3-1 no és més que una solució provisional, ja que té un important límit, no inclou la manera virtual i multitarea. Quant al sistema operatiu que seguirà, Microsoft no vol avançar massa informació. Treballa en tres línies diferents. D'una banda, està la versió del sistema Unix Xenix V/386, elaborat per Microsoft. S'espera trobar-ho al carrer a l'inici de l'any. A pesar que aquest sistema operatiu és molt conegut i comença a obrir noves vies en el mercat, té un inconvenient: No ser compatible amb la versió actual del sistema DOS.
Per això, Seattle vol treure dos nous productes a l'inici de l'any. El primer seria una versió especial de l'entorn operatiu WINDWS adaptat al processador 80386. Segons Scott Treseder (portaveu de la Companyia), aquesta versió incorporarà el sistema operatiu i permetrà executar diversos programes simultàniament i sense interferir entre ells. Per a aconseguir-ho, s'hauria de fer funcionar el microprocessador de manera virtual, que simula 8086 processadors per a cada aplicació o programa.
El segon producte és la versió 5 de DUES tan popular, que també pot denominar-se Advanced DUES 1.0. Aquesta versió requerirà coses molt més sofisticades com la comunicació entre processos, l'ús de la memòria de 16 Mbyte, la multitarea i les utilitats de control de processos en temps real. Aquest sistema operatiu, orientat a cobrir necessitats més complexes que les dels usuaris actuals dels PCs, provocarà l'aparició d'un nou tipus d'aplicacions com a bases de dades distribuïdes, sistemes de control de processos, etc.
No obstant això, mentre no surtin aquests productes, moltes empreses de programari estan desenvolupant nous sistemes operatius per a cobrir el buit que hi ha en el mercat. Aquest és el cas del sistema desenvolupat per PC/MOS/386 Programari Luik. Es tracta bàsicament d'una versió d'MS-DOS que inclou la multitarea, dirigida a aquells usuaris que, malgrat estar a gust amb els programes que contenen, desitjarien que un conjunt de programes s'executin conjuntament. Per part seva, Pick s'ha mostrat totalment contrari. El sistema operatiu que ofereix aquesta casa és incompatible amb MS-DOS.
Finalment, també existeixen hiperobservadores, programes de control que permeten tenir carregats diversos sistemes operatius en la memòria simultàniament.